کنگره بین المللی پیشگیری از سرطان

صفحه اصلی / اولین کنگره بین المللی پیشگیری از سرطان

الگوریتمهای یادگیری ماشین در تحلیل داده‌های توالی-RNA(RNA-Seq) بیماران سرطانی

نویسندگان :

فاطمه قلی پور¹ علی محمدیان مصمم² بهنام آقاجان³

1- دانشگاه زنجان 2- دانشگاه زنجان 3- دانشگاه زنجان

کلمات کلیدی :

الگوریتم‌های یادگیری ماشین،بیان ژن،RNA-Seq،SVM

چکیده :

با توسعه فناوری‌های نوین در عرصه پزشکی، حجم عظیمی از داده‌های مرتبط با سرطان گردآوری شده و در اختیار جامعه پژوهشی قرار گرفته است. استفاده از هوش مصنوعی و یادگیری ماشین در حوزه‌های مختلف پزشکی، به‌ویژه در پیش‌بینی، غربالگری و تشخیص سرطان، با هدف بهبود دقت و کارایی انجام می‌شود. با توجه به پیچیدگی و حجم بالای داده‌های ژنتیکی، یادگیری ماشین قادر است الگوهای پنهان را شناسایی کرده و دقت پیش‌بینی را نسبت به روش‌های سنتی افزایش دهد. در این مقاله با استفاده از الگوریتم‌های یادگیری ماشین به طبقه‌بندی داده های توالی نسل بعدی(NGS) بویژه داده‌های(RNA-Seq) می پردازیم. داده های مورد مطالعه در این مقاله سرطان دهانه رحم با بیان‌های 714 میکرو RNA (miRNA) از نمونه‌های انسانی را اندازه‌گیری کرده است. در این مجموعه داده، 29 نمونه توموری و 29 نمونه غیرتوموری از دهانه رحم وجود دارد و این دو گروه به عنوان دو کلاس جداگانه در نظر گرفته می‌شوند.